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27th place solution , with potential gold

499. UW-Madison GI Tract Image Segmentation | uw-madison-gi-tract-image-segmentation

开始: 2022-04-14 结束: 2022-07-14 医学影像分析 数据算法赛
第27名解决方案,具有金牌潜力

第27名解决方案,具有金牌潜力

作者: Satwik (Expert)
比赛排名: 第27名

大家好,祝贺所有的获奖者!
我的解决方案基本上是开箱即用的 nnUNet,它带我飞。

我使用 nnUNet 训练了3个模型,采用了 nnUnet trainerV2 fp32,并使用了不同的 DA(数据增强)设置 ——

公共排行榜

默认设置 疯狂数据增强 无数据增强 加权集成 (0.6, 0.25, 0.15)
0.881, 使用TTA为 0.883 0.878, 使用TTA为 0.881 0.875 0.885

我添加了一个简单的后处理方法,这是 Darien 发布的 —— 删除所有切片 138-144 的预测。
这个后处理对我在公共排行榜上没有影响,但在私有排行榜上增加了 +0.001。

私有排行榜

默认设置 疯狂数据增强 无数据增强 加权集成 (0.6, 0.25, 0.15)
0.872 0.872, 使用TTA为 0.877(!) 0.865 0.877

一些见解

“疯狂数据增强”模型在私有排行榜上表现非常好,但在公共排行榜上与其他实验相比表现不佳。
我在集成中给该模型的权重也非常低,仅为 0.25,并且没有对其进行 TTA(测试时增强)。
如果我把 insaneDA 模型作为主模型,在私有榜上达到 0.88 是完全可行的。
我也曾想将 3D nnUnet 与 2.5D 模型进行集成,但是我的 2.5D 模型分数无法超过 0.87,因此决定放弃。然而,根据 Carno 的实验,即使其中一个分数相对较低,集成 2.5D 和 3D 似乎也能带来相当不错的提升 (0.003)!我也成功从公共榜第45名逆袭到了私有榜第27名。

感谢所有分享宝贵见解的人,我从这次比赛中学到了很多!

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