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5th place solution

459. RSNA-MICCAI Brain Tumor Radiogenomic Classification | rsna-miccai-brain-tumor-radiogenomic-classification

开始: 2021-07-13 结束: 2021-10-15 医学影像分析 数据算法赛
第5名方案
作者: Bhavesh Tangirala | 排名: 第5名

第5名方案

我要感谢 Kaggle 和竞赛主办方提供的这次学习机会。

代码链接:Github

数据集

模型训练使用了这个 Kaggle 数据集。感谢 @jonathanbesomi 为我们提供这个精简的数据集。

方法

  • 我对每种类型的 mpMRI 扫描(即 FLAIR、T1w、T1Gd、T2)各采样了 10 张图像,并计算每种类型的平均值,从而得到 4 张 2D 图像。
  • 然后,我将这 4 张图像拼接起来,得到一个 4 通道(4 x h x w)的图像,并将其通过一个 1x1 卷积瓶颈层,以获得一个 3 通道(3 x h x w)的特征图。
  • 该特征图通过一个 CNN(Efficientnet)来预测 MGMT 值。
  • 我使用了泰勒交叉熵损失进行训练,因为我认为由于样本数量较少,该数据集可能存在一些噪声。

代码笔记本

训练笔记本:https://www.kaggle.com/abhimanyukarshni/rsna-training/notebook

推理笔记本:https://www.kaggle.com/abhimanyukarshni/rsna-inference/notebook

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