517. Open Problems - Multimodal Single-Cell Integration | open-problems-multimodal
首先,感谢组织者、Kaggle 管理团队以及所有与我一起参赛的选手。
由于我需要积累分析单细胞数据的经验,这次比赛对我来说是一次极佳的历练。
下面我将介绍我的解决方案概览。
基于 tSVD 的插补方法:
在推理阶段,模型输出五个预测目标数据的平均值。
在 CITEseq 中选择重要基因时,计算每个批次的相关系数,并仅选择在许多批次中具有高相关性的基因。
基因是从与目标蛋白和通路相关的基因中选出的。
我使用 Reactome 作为通路数据库。